Главный герой — Такаши Нацумэ и ему в наследие от бабушки досталась одна способность, а если быть точнее — видеть духов, причём как добрых так и злых, которые ему докучают. Этот весьма тяжелый дар, все время мешал ему жить и окружающие конечно же не верили в то что Нацумэ видит духов. Но всё стаёт на свои места, когда он переезжает в город, где жила его бабушка и находит "тетрадь дружбы" своей бабушки Рэйко, в которую она записывала имя каждого духа. Теперь ему стало понятно почему он видит духов и как избавиться от этой способности. При сопровождении мощного духа Мадары, Нацумэ начинает освобождать других духов от контракта заключенного с его бабушкой.