После событий второго фильма наш герой, Синдзи Икари, пробуждается спустя 14 лет, ощущая полную путаницу и непонимание. Однако постепенно развертывается перед ним устрашающая правда. Он обнаруживает, что должен снова встать на борьбу с таинственными Ангелами, но на этот раз ему придется противостоять им вместе с неожиданными союзниками.
В процессе этой эпической битвы, Синдзи сталкивается с неожиданным сопротивлением со стороны своих бывших друзей, что только добавляет остроты и сложности к его судьбе. Он сталкивается с невероятными испытаниями, вынужден принимать решения, которые затрагивают судьбу всего человечества.
Сейчас, на передовой войны, Синдзи Икари должен сделать выбор, который определит будущее всего мира. Что будет он выбирать в данной ситуации? Ответ лежит в его руках.
Чтобы жить — нужно меняться и пробовать что-то новое.