Япония была практически уничтожена в результате Второго удара. Всё, что от неё осталось — это мегаполис Токио-3, из-зи неуклонных атак существ великанов, намеревающихся истребить человечество, известных как Ангелы. Синдзи Икари, который не видел своего отца в течении трёх лет, однажды получает от него звонок с приказом присоединиться к Nerv — организации, борющейся против Ангелов. Эта группа использует огромных роботов, названных Евангелионами, в своей битве. Пильотирование Евы-01 становится миссией Синдзи. Ему предстоит работать в тесной команде с Управляющим Евой-00, Рей Аянами.
В результате Второго удара, Япония была на грани уничтожения. Токио-3, единственный оставшийся в стране мегаполис, испытывает постоянный натиск существ гигантов, известных как Ангелы, действующих с целью истребления человечества. Синдзи Икари, который не контактировал с отцом более трёх лет, получает от него срочный звонок, призывающий присоединиться к организации под названием Nerv, поставившей своей целью борьбу с Ангелами. В арсенале этой группы находятся громадные роботы, Евангелионы, которые являются основным оружием в битве против врага. Становится известно, что обязанностью Синдзи является управление Евой-01, равно как и совместная работа с пилотом Евы-00 — Рей Аянами.
Ты ничего не мог поделать, со страхом узнать, что другие думают о тебе, потому ты избегал всех.