По прошествии трех лет события аниме-сериала возвращаются. Бывшие избранные жили спокойной и обычной жизнью. Но эту идиллию нарушает появление нового врага в Цифровом мире. Он использует темные кольца и башни для порабощения частей мира, которые затем превращаются в странные спирали. Все дигимоны становятся рабами этого врага, известного как "Кайзер Дигимонов". Чтобы противостоять новому врагу, было созвано пятеро новых избранных детей, включая детей предыдущего поколения. С помощью своих друзей они устраняют угрозу и обнаруживают, что враг является одним из гениальных учеников школы. Этот бывший ученик, потерявший брата от руки избранных, решает захватить Цифровой мир из ревности. Но вскоре вторая пара врагов вторгается в Цифровой мир, создавая хаос. Кайзер понимает свои ошибки и решает помочь избранным в их борьбе. Несмотря на их недоверие, ребята решают объединиться против врагов. Однако появляется еще одна проблема: мощный дигимон выходит из-под контроля и начинает разрушать все вокруг. Смогут ли избранные ребята остановить его и спасти Цифровой мир от всех обидчиков?